简介
CRM系统推荐!NCBI (National Center for Biotechnology Information) 是美国国立卫生研究院 (NIH) 下属的一个部门,负责收集、组织和提供生物信息学信息。NCBI数据库是世界上最全面的生物学信息数据库之一,涵盖了广泛的生物学领域,包括基因序列、蛋白质序列、结构数据、基因组信息和文献。Python爬虫服务!
主要数据库
WordPress建站!NCBI数据库由一系列相互关联的数据库组成,其中包括:
- GenBank:包含了超过 1.4 亿条核苷酸序列记录,代表了地球上所有已知生物体的 DNA 和 RNA 序列。
- RefSeq:提供了基因组的参考序列,包括染色体和非编码 RNA。
- UniProt:收集了来自所有已知生物体的蛋白质序列。
- PubMed:包含了超过 3400 万篇生物医学和生命科学文献的引用。
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BLAST:一种强大的序列比对工具,用于搜索相似序列。
数据获取
NCBI数据库的数据可以通过多种方式获取,包括:
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Entrez:一个统一的搜索门户,允许用户搜索 NCBI 的所有数据库。
- E-Utilities:一组编程接口,允许程序员编写自己的脚本从 NCBI 数据库中获取数据。
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FTP:可以批量下载整个数据库。
应用
NCBI数据库被广泛用于生物医学研究和生物信息学中,其中一些应用包括:
- 比较基因组
- 发现疾病的生物标志物
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开发新药
优点
NCBI数据库具有许多优点,包括:
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全面性:涵盖广泛的生物学领域,拥有世界上最全面的生物学信息集合。
- 免费获取:所有 NCBI 数据库都可以免费在线获得。
- 易于使用:提供了用户友好的界面和强大的搜索工具。
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高度引用:NCBI 数据库被广泛引用为生物医学研究的权威来源。
局限性
NCBI数据库也有一些局限性,包括:
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数据质量:虽然 NCBI 采取措施确保数据的质量,但用户在使用数据之前始终应仔细审查数据。
- 数据量:NCBI 数据库庞大,有时可能难以导航和分析数据。
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更新频率:某些 NCBI 数据库可能无法实时更新,因此可能无法反映最新信息。
总结
NCBI数据库是生物信息学领域的宝贵资源,提供了广泛的生物学信息。它被广泛用于研究和开发,其全面性、免费获取和易用性使其成为生物医学研究人员和生物信息学家的必备工具。
问答
- NCBI 数据库由哪些主要数据库组成?
- GenBank、RefSeq、UniProt、PubMed、BLAST
- 如何从 NCBI 数据库获取数据?
- Entrez、E-Utilities、FTP
- NCBI 数据库有什么优点?
- 全面性、免费获取、易于使用、高度引用
- NCBI 数据库有什么局限性?
- 数据质量、数据量、更新频率
- NCBI 数据库在生物医学研究中有何应用?
- 识别基因和蛋白质、比较基因组、发现疾病生物标志物、开发新药
原创文章,作者:胡辰雅,如若转载,请注明出处:https://www.wanglitou.cn/article_57467.html