NCBI 子数据库
简介
美国国家生物技术信息中心 (NCBI) 是一份免费的数据库资源，由美国国家医学图书馆 (NLM) 维护。它提供了广泛的生物医学和基因组学信息，包括核苷酸序列、蛋白质序列、结构数据和基因表达信息。NCBI 由多个子数据库组成，每个子数据库都有其特定的焦点和内容。
主要子数据库
NCBI 的主要子数据库包括：
- GenBank：一个核苷酸序列数据库，包含来自各种生物体的 DNA 和 RNA 序列。
- RefSeq：一个参考序列数据库，提供高注释和高质量的核苷酸和蛋白质序列。
- PubMed：一个生物医学和生命科学文献的综合索引数据库。
- PubMed Central (PMC)：一个免费的全文期刊文章数据库。
- Entrez：一个搜索工具，允许用户同时搜索 NCBI 的所有子数据库。
- BLAST：一个序列比对工具，用于识别序列相似性。
- SRA：一个高通量测序数据的档案馆。
- BioSystems：一个生物途径和基因组组织信息数据库。
- GEO：一个基因表达数据的公共存储库。
- dbGaP：一个基因组学和表型数据的存储库。
子数据库的用途
每个 NCBI 子数据库都有其特定的用途和目标受众。例如：JS转Excel!
- GenBank 被研究人员用于搜索特定的基因和蛋白质序列，并分析它们的结构和功能。
- PubMed 被生物医学专业人士用于查找有关特定疾病、治疗方法和其他生物医学主题的最新信息。
- PMC 被研究人员和学者用于获取免费的全文本期刊文章。
- Entrez 被用户用于同时搜索 NCBI 的所有子数据库，以获取全面的搜索结果。
- BLAST 被研究人员用于比较序列相似性，并确定可能的基因功能。
- SRA 被研究人员用于分析高通量测序数据，例如RNA测序和全基因组测序。
- BioSystems 被研究人员用于探索生物途径和基因组组织。
- GEO 被研究人员用于比较基因表达模式，并确定特定细胞或组织中的基因表达差异。
- dbGaP 被研究人员用于研究基因组学数据，以了解疾病的遗传基础。
子数据库之间的交互
NCBI 子数据库通过各种方式进行交互，以提供全面的生物医学信息资源。例如：
- GenBank 中的序列可以与 PubMed 中的文章进行交叉引用，以提供有关特定基因或蛋白质的背景信息。
- Entrez 可以用于同时搜索 GenBank 和 PubMed，以查找有关特定基因或疾病的信息。
- BLAST 可以用于将 GenBank 中的序列与其他数据库中的序列进行比较，例如 PDB（蛋白质数据库）。
- BioSystems 中的途径信息可以与 GEO 中的基因表达数据相结合，以了解基因在特定途径中的作用。
结论
NCBI 子数据库构成了一个强大的生物医学信息资源，为研究人员、学者和医疗保健专业人员提供了全面的工具和数据。通过利用这些子数据库，用户可以获取有关基因、蛋白质、疾病、治疗方法和其他生物医学主题的最新信息。王利头,
问答
-
NCBI 的主要子数据库有哪些？
- GenBank、RefSeq、PubMed、PMC、Entrez、BLAST、SRA、BioSystems、GEO、dbGaP
-
GenBank 中存储哪些类型的数据？wanglitou.
- 核苷酸序列（DNA 和 RNA）
-
PubMed 和 PMC 之间的区别是什么？
- PubMed 是一个期刊文章的索引数据库，而 PMC 是一个全文期刊文章的数据库。
-
Entrez 如何帮助用户？HTML在线运行,
- 它允许用户同时搜索 NCBI 的所有子数据库。
-
BLAST 有哪些用途？
- 确定序列相似性并预测基因功能。
原创文章，作者：胡辰雅，如若转载，请注明出处：https://www.wanglitou.cn/article_51045.html
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