ncbi是什么数据库

简介

NCBI（国家生物技术信息中心）是一个由美国国立医学图书馆（NLM）维护的生物医学和基因组数据库集合。它提供广泛的生物信息学工具和资源，包括序列数据、文献、基因表达数据和蛋白质结构信息。

主要数据库

NCBI 主要包含以下数据库：

• GenBank：包含超过 2.2 亿条碱基序列，涵盖广泛的物种和生物分子。
• RefSeq：包含高质量的参考序列，代表特定物种或基因组中的遗传信息。
• PubMed：索引超过 3400 万篇生物医学文献。
• GEO：存储基因表达数据，包括微阵列和 RNA 测序数据。
• 蛋白质数据银行（PDB）：包含蛋白质结构信息，包括原子坐标和与其他分子的相互作用。

特征和优势

NCBI 提供以下特征和优势：

• 集中访问：允许用户在一个平台上查询和检索来自不同来源的生物医学数据。
• 广泛的覆盖：覆盖广泛的物种、生物分子和生物医学领域。
• 数据质量：序列和文献数据经过仔细策展和注释，以确保高质量。
• 先进的搜索工具：强大的搜索工具允许用户根据物种、基因、文献标题或其他参数对数据进行过滤和排序。
• 免费和公开访问：所有 NCBI 数据库都是免费和公开访问的，无使用限制。

应用

NCBI 数据库在生物医学研究和实践中具有广泛的应用，包括：

• 生物信息学研究：用于识别新基因、研究基因表达和进行比较基因组学分析。
• 医学研究：用于诊断疾病、开发治疗方法和研究疾病机制。
• 生物技术行业：用于药物发现、基因工程和生物技术产品开发。
• 教育和培训：作为生物信息学、基因组学和生物医学的教学和培训资源。
• 公众健康：用于监测疾病爆发、识别流行病和进行公共卫生研究。

常见问答

1. NCBI 与 BLAST 有什么关系？

BLAST（基本局部比对搜索工具）是 NCBI 开发的搜索算法，用于在数据库中比较序列和查找相似性。

2. NCBI 如何确保数据质量？

序列数据通过自动验证和手动策展进行质量控制。文献数据由专家索引员索引和注释。

3. NCBI 的使用是否有限制？

所有 NCBI 数据库都是免费和公开访问的，无使用限制。

4. NCBI 数据如何更新？

NCBI 数据库不断更新，每天添加新的数据和序列。

5. NCBI 除了数据库外，还提供哪些其他资源？

NCBI 还提供生物信息学工具、教育材料、软件和培训服务。